在氣相色譜分析中，為了得到準確的分析結果，實驗操作人員不僅要選擇合適的設備，也要選擇合理的分析方法，認真做好每一步的工作，才能保證分析結果的準確性。

氣相色譜分析進樣有手動進樣和自動進樣兩種方式。手動進樣使用微量注射器直接進樣，應選用體積合適的注射器，進樣時要求注射速度快，取樣準確、重現(xiàn)，避免樣品之間的交叉污染。自動進樣采用自動進樣器，通常具有可變的注射速度、寬范圍的進樣體積、適用于多種進樣模式等功能。

由于氣相色譜儀的進樣量較小，手動進樣誤差較大，所以條件允許的話，盡量使用自動進樣器。較之于手動進樣，全自動進樣器具有更高的進樣準確性和重現(xiàn)性，可實現(xiàn)自動分析。

進樣速度必須很快，因為當進樣時間過長時，樣品原始寬度將變大，色譜峰半峰寬隨之變寬，有時甚至使峰變形。一般進樣時間應在1s以內。

進樣量要適當，一般液體樣品進樣量為0.1μl~10μl，氣體樣品進樣量為0.1ml~10ml。進樣量太少，會使微量組分因檢測器靈敏度不夠而無法檢出；進樣量太大，會使幾個色譜峰重疊在一起而影響分離。大允許的進樣量，應控制在峰面積或峰高與進樣量呈線性關系的范圍內。

當進樣量較小時，峰高與進樣量成比例，保留時間不隨進樣量變化，兩組分分離情況也保持不變；當進樣量超過大允許進樣量時，即色譜柱已超載，柱效大大降低，特別是使用低配比固定液時，柱效對進樣量變化更為敏感。